スポンサードセッション・NGSよろず相談所_第3回

ランチョンセミナー

ID LS1a 日時 2013/9/4(水) 12:00-13:00 会場 A
スポンサー ライフテクノロジーズジャパン株式会社
発表内容 「ターゲットリシーケンスのための新世代ツール – Ion AmpliSeq™ テクノロジー」
熊井 広哉 (ライフテクノロジーズジャパン株式会社 マーケティング)
要旨 ベンチトップ次世代シーケンサの登場により、大きくの研究室に次世代シーケンサが普及するようになりましたが、限られた解読能力(スループット)を活用するためには、エクソームシーケンスやさらにターゲット領域を絞り込んだターゲットリシーケンスのための手法が求められています。Ion Torrent™でターゲットリシーケンスを効率的に行うために開発されたIon AmpliSeq™ テクノロジーは、ヒトおよびマウスの数Mb程度までの標的領域のターゲットリシーケンシングを可能にします。ウルトラマルチプレックス PCR の条件を最適化することで、1本のチューブ内で最大6,144か所のターゲットをPCRで増幅し、目的のDNA領域を選択的に濃縮することが可能で、現在エクソームをカバーするだけの領域を、短時間で、簡単に増幅することができるようになりました。これまで、数日かけてエクソーム領域を濃縮していたプロセスは、劇的に短縮、簡略化され、迅速で低コストなエクソーム解析が可能になります。国内の活用事例を詳しくご紹介いたします。
ID LS1b 日時 2013/9/4(水) 12:00-13:00 会場 B
スポンサー タカラバイオ株式会社
発表内容 NGSとPCR酵素の良い関係
北川 正成(タカラバイオ株式会社 バイオ研究所長)
要旨 NGS解析において、PCRは非常に重要な技術の一つです。タカラバイオでは、例えば、NGSライブラリの調製、増幅、定量などのNGSアプリケーションに適した酵素の開発を行っています。弊社のPrimeSTAR®シリーズは、そのようなPCR酵素の製品のひとつですが、DNA増幅の正確性、スピード、効率、長さ、特異性などの点で多くの利点を持っています。また、Tks Gflex® DNAポリメラーゼは、これらの特徴に加えて、さらに高いPCR成功率を実現した新しい酵素です。一方、これらの技術は微量RNAから増幅cDNA調製可能なSMARTer® Ultra Low RNA Kit for Illumina® SequencingをはじめとするNGS関連の製品にも活かされています。本セミナーでは、タカラバイオのPCR酵素とその技術を紹介し、いくつかのNGSアプリケーションでの有用性などを示したいと思います。
ID LS1c 日時 2013/9/4(水) 12:00-13:00 会場 C
スポンサー 日本SGI株式会社
発表内容 A versatile platform for analysis of individual, population and relational genomics
Eng Lim Goh, Ph.D (米国Silicon Graphics International Corp. シニアバイスプレジデント兼最高技術責任者 工学博士)
要旨 Researchers are developing new and adaptive workflows to extract more value from their higher velocity sequencer data. In doing so, they may draw upon changing combinations of in-house, off-the-shelf and open source tools and applications. With datasets growing, a versatile platform that is data-scalable yet can run applications unmodified is becoming a science productivity tool.
ID LS2a 日時 2013/9/5(木) 12:50-13:50 会場 A
スポンサー アジレント・テクノロジー株式会社
発表内容 講演1:「本音で語ろうNGS! NGSオミクス解析でどこまで出来る?」
鈴木 穣 (東京大学大学院新領域創成科学研究科)

講演2:「エクソームシーケンスだけじゃない! アジレントの各種NGSソリューション」
箕浦 加穂 (アジレント・テクノロジー株式会社 ゲノミクス部門 バイオアプリケーショングループ)

要旨 次世代シーケンサの応用はここ数年急速な勢いで浸透し、様々な生物のバイオロジーばかりではなく、将来の診断応用を視野に入れたヒトの疾患研究まで多様な広がりを見せています。しかし、がんや一般的な疾患の解明には、現行のテクノロジーにまだ大きな課題があるのも事実です。今回のランチョンセミナーでは、NGSによるターゲットキャプチャやRNA-Seq、ChIP-Seqなどを組み合わせたオミクス解析の現状とその可能性について、東京大学の鈴木先生に解説いただきます。またアジレント社からは、エクソームに種々の領域をプラスした各種デザインや、NGS自動化ロボット、ライブラリQCなどの新しいソリューションをご紹介します。
ID LS2b 日時 2013/9/5(木) 12:50-13:50 会場 B
スポンサー NuGEN Technologies
発表内容 「ピコグラム・オミックスを乗り越えて(Conquering Picogram-Omics)」
中村 正裕 (京都大学iPS細胞研究所)
要旨 現在のNGSライブラリーソリューションの問題としてナノグラム単位のインプットDNAが要されることがあり、ピコグラムレベルの微量サンプルについてはシーケンス困難とされてきました。NuGEN社では独自のRibo-SPIA® (Single Primer Isothermal Amplification) 増幅技術をOvation® RNA Seq-V2に用いることで、約4時間で500 pg~100 ngのtotal RNAからµgオーダーのcDNAを増幅することができます。自動ライブラリー作成システムのMondrianTM SPを用いた、微量DNAサンプルにおけるOvation SP Ultralow ライブラリ作成法ではChIP-seqにおいては250 pg程度の微量のChIP-DNAでもシーケンス可能であり、RNA-seqにおいてもデータの品質や再現性に優れていました。ピコグラム・オミックスのハードルをクリア出来れば、様々な医学的な課題の答えに繋がることが期待され、貴重な臨床サンプルや幹細胞の研究に大きく貢献すると考えております。今回は京都大学iPS細胞研究所の中村正裕先生に実際のデータとご体験を交えて、現在までの研究成果についてご講演をいただきます
ID LS2c 日時 2013/9/5(木) 12:50-13:50 会場 C
スポンサー 株式会社パーキンエルマージャパン
発表内容 「Spotfire OMICSソリューション紹介 -Integromics OmicsOffice for TIBCO Spotfire-」
大石 尚孝 (株式会社パーキンエルマージャパン・インフォマティクスフィールドマーケッティングマネージャー)
要旨 TIBCO SpotfireR とは、大量データをインメモリーにて処理し、インタラクティブな解析プラットフォームを提供するアプリケーションです。研究者はより迅速に新たな知見を得る事ができます。Integromics’OmicsOffice RはSpotfireのプラットフォーム上でバイオインフォマティクス研究に必要なhigh-throughputの生物学的データに対処する為に特別に設計された統合解析ツールです。一版的なクラスター解析、主成分分析は勿論、LIMMA、Two factor ANOVAなどの解析手法も含まれております。また解析結果をWebベースのダッシュボードとしてアップロードし、情報の共有化も可能となります。この一連の操作において特別なプログラム開発は必要としません。ランチョンセミナーではSpotfireのインタラクティブな解析プラットフォームをデモンストレーションを中心に紹介させて頂きます。

モーニング教育セッション

ID SSmm 日時 2013/9/5(木) 8:00-8:50 会場 D
スポンサー 株式会社ジナリス
発表内容 「いまさら聞けない NGS超!入門
竹田 綾 (株式会社ジナリス)
要旨 これからNGSを始める人など超初心者を対象に、NGS基礎中の基礎をお話します。シーケンサーの歴史から、現在活躍中・今注目を浴びている機器の話、解析アプリケーション例、基本用語など、浅く広くご紹介します。また各トピックにおいて、さらに詳しく知りたいときの「NGS情報収集術」にも注目です。
  レベルの参考:
  (1) NGSで何ができるの?
  (2) Phred Scoreって?
  (3) ゲノムアセンブリーの統計値 N50って何?
  (4) MiSeqとIonPGM以外にどんなシーケンサーがあるの?

NGSよろず相談所

ID LS1d, LS2d 日時 9/4(水)12:00-13:00, 9/5(木)12:50-13:50 会場 D
スポンサー 株式会社データダイレクト・ネットワークス・ジャパン
要旨 NGSを始めてみたけど、困ったことがある方を対象に、エキスパートと直接意見交換ができる企画です。